جوجه کشی ها مراکز صنعتی هستند که با استفاده از انکوباتور و با کنترل دما و رطوبت محیط، تخم های حاوی نطفه که توسط مرغ های تخم گذار تولید شده است را در یک فرآیند مصنوعی به جوجه تبدیل می‌کند.
بهداشت و عدم آلودگی فضای کارخانه‌های جوجه کشی باعث افزایش راندمان تولید جوجه می‌شود از این رو بسیاری از جوجه کشی ها در فاصله زیادی از واحدهای مرغداری قرار دارند تا خطرات انتقال آلودگی‌ها را به حداقل برسانند.
مراحل رشد نطفه در تخم ها به دو دوره ستر و هچر تقسیم می‌شود و پس از پایان دوره هچر که در این دوره دما و رطوبت در اتاق‌های مخصوص کمتر از دوره ستر است، جوجه ها از تخم خارج می شوند.
این بخش از فاضلاب که حجم عمده فاضلاب مربوط به کارخانجات جوجه کشی است. که حاصل از شستشوی سبد های نگهداری تخم مرغ در هجر و ستر می باشد. علاوه بر این تلفات ناشی از شکسته شدن تخم مرغ ها یا معدوم شدن تخم مرغ های نابارور، باعث آلودگی شدید این حجم از فاضلاب می شود. این پساب به دلیل استفاده کردن مواد شوینده و ضد عفونی کننده و وجود بقایای تخم مرغ جزو فاضلاب های نیمه سنگین به حساب می آید.
فاضلاب ناشی از شستشوی واحدها، سالن‌ها و تجهیزات در پایان دوره جوجه‌ریزی و فاضلاب ناشی از ضد عفونی کردن سالن‌ها که به صورت دوره ای انجام می‌شود و حاوی مواد شوینده و ضد عفونی کننده است.
فاضلاب بهداشتی تولید شده در سرویس‌های بهداشتی که حتما می‌بایست از محیط دور و تصفیه شوند.
به دلیل اهمیت بالای کنترل بار میکروبی در این واحد ها بهداشت فردی کارکنان از اهمیت بالایی برخوردار است به نحوی که کلیه پرسنل قبل از ورود به سالن‌ها می‌بایست دوش گرفته و از لباس شسته و ضد‌عفونی شده استفاده کنند.
در صورت وجود غذاخوری و آشپزخانه در کارخانه این فاضلاب نیز که دارای چربی و روغن بالایی است به سیستم تصفیه فاضلاب جوجه کشی افزوده می‌شود.
کلیه فاضلاب های ایجاد شده در جوجه کشی از طریق منهول‌ها و عبور از آشغال گیر‌ها و جدا شدن پوسته‌های تخم مرغی که ناخواسته وارد فاضلاب شده اند وارد سیستم تصفیه خانه می‌شود.
از نکات مهم و حائز اهمیت در تصفیه فاضلاب جوجه کشی وجود آلبومین موجود در تخم مرغ با محتوای نیتروژن و فسفر بالا است که نیاز به روش های مدرن و کارامد به منظور تصفیه کامل و حذف نیتروژن و فسفر مازاد می باشد حذف پسماند های تولید شده و انتقال آن ها به واحد پخت ضایعات و جلوگیری از ورود این پسماندها به تصفیه خانه بسیار وابسته به نحوه عملکرد کارکنان خط تولید است.
میزان فاضلاب تولید شده در جوجه کشی ها بسیار وابسته به تعداد دستگاه ها ی جوجه کشی و علاوه بر این نحوه شستشوی سبدها و دستگاه‌ها توسط کارکنان و تعداد پرسنل است علاوه بر این تولید فاضلاب در واحدهای جوجه کشی به صورت پیوسته نبوده و در طی چند روز که عموما سه روز در هفته هست، تولید می‌شود.
شرکت رادزیست شیمی کاسپین با تجربه‌ی ساخت تصفیه خانه برای بیش از 30 واحد جوجه کشی در کشور به عنوان بزرگترین شرکت در زمینه تصفیه فاضلاب جوجه کشی در کشور شناخته شده است.